游戏的冒险舞台是过去的神奥地区，即“洗翠地区”，当时还没有宝可梦训练家和宝可梦联盟的概念。玩家将扮演一名从现代穿越过去的训练师，被阿尔宙斯委托去“了解所有的宝可梦”，并加入银河队，在拉苯博士的委托下，以完成洗翠地区第一本宝可梦图鉴为目标展开冒险